Kancelarija za profesionalne standarde je osnovna organizaciona jedinica koja se nalazi u Upravi Direkcije, neposredno podređena direktoru i zamjenicima direktora.
U Kancelariji za profesionalne standarde, osnivaju se unutrašnje organizacione jedinice, i to:
a) Odsjek za unutrašnju kontrolu koji vrši poslove i zadatake;
1) istrage povodom neposrednog uočavanja propusta u radu i predstavki koje se odnose na nepravilno ponašanje i rad policijskih službenika i ostalih zaposlenih u Direkciji;
2) podnosi i zastupa disciplinske zahtjeve u postupcima pred disciplinskim organima Direkcije i drugih Agencija;
3) sprovodi inspekcijsko nadzorne postupke u Direkciji, te istražne postupke o upotrebi sredstava prinude, prekoračenju policijskih ovlaštenja, korupcije, ostvaruje neophodnu internu i eksternu saradnju sa nadležnim službama i organima u cilju sprovođenja istrage;
4) o rezultatima istrage upoznaje direktora i zamjenike direktora Direkcje i istim dostavlja završni izvještaj, predlaže mjere i druge radnje u skladu sa načelima o vršenju poslova inspekcije i unutrašnje kontrole;
5) postupa po zahtjevima Nezavisnog odbora kao nezavisnog tijela policijske strukture BiH i Odbora za žalbe građana na postupanje policijskih djelatnika BiH, kao nezavisnog tijela Parlamentarne skupštine BiH;
6) sačinjava potrebne planove rada i izvještaje o radu;
7) vodi potrebne evidencije i stara se o njihovom čuvanju, vodi registre pritužbi i žalbi građana, registre o upotrebi sredstava prinude i registre o izvršenoj inspekciji i;
8) druge poslove u skladu sa propisima iz nadležnosti Odsjeka i po uputstvima Direktora, zamjenika direktora i utvrđenim smjernicama.
b) Odsjek za zaštitu podataka koji vrši poslove i zadatake;
1) preduzimanja mjera na fizičkoj, tehničkoj i drugoj zaštiti dokumenata označenih sa stepenom tajnosti „Povjerljivo“, „Tajno“ i „Vrlo tajno“;
2) zaštite ličnih podataka vezano za zakonito raspolaganje, čuvanje, registraciju bazi podataka kod Agencije za zaštitu ličnih podataka BiH, otpremu i uništavanje zaštićenih dokumenata i evidencija o ličnim podacima;
3) poslove vezano za usavršavanje i provođenje fizičkih, organizacionih i tehničkih standarda zaštite tajnih podataka Direkcije, primjene sigurnosne mjere u informacionom i elektronskom sistemu zaštite;
4) poslove na sprječavanju nezakonitom korištenju podataka, kao i onemogućavnju pristupa neovlaštenim licima navedenim podacima, u skladu sa Zakonom o zaštiti tajnih podataka („Službeni glasnik BiH“, br. 54/05, 54/07 i 12/09) i Zakonom o zaštiti ličnih podataka („Službeni glasnik BiH“, broj 49/06), drugim zakonskim i podzakonskim aktima iz navedenih oblasti;
5) poslove vezane za prijem, otpremu, čuvanje, arhiviranje i vođenje potrebnih upisnika i evidencija zaštićenih dokumenata, planova bezbjednosti i registraciji evidencija kojima se obrađuju lični podaci, kao i druge poslove i zadatke iz nadležnosti Odsjeka i po uputstvima Direktora, zamjenika direktora i utvrđenim smjernicama.